产品货号:
YTB4188
中文名称:
RNase H
英文名称:
Ribonuclease H
产品规格:
250U|1000U|5000U
发货周期:
1~3天
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本制品是从大肠杆菌表达纯化获得的一种核糖核酸内切酶,可以特异性地水解DNA-RNA杂合链中的RNA。RNase H不能水解单链或双链DNA或RNA中的磷酸二酯键,即不能消化单链或双链DNA或RNA。RNase H广泛用于消化降解cDNA第二链合成后形成的DNA和RNA杂合双链中的RNA,或用于去除杂交到oligo (dT)上的mRNA poly(A)等。分子量约18.4kDa (单体)。
特异性消化DNA-RNA杂合链中的RNA,常用于cDNA第二链的合成。
DNA-RNA杂合链中去除RNA,例如cDNA第二条链合成前去除RNA;RT-PCR/RT-qPCR实验中,cDNA一链合成后去除RNA;通过互补的DNA序列实现对RNA的定点剪切;除去杂交到poly(dT)上的mRNA中的poly(A);体外多腺苷酸化反应(polyadenylation reaction)产物研究;DNA-RNA杂合双链的鉴定。
纯化自携带编码大肠杆菌RNase H核糖核酸内切酶基因的E.coli重组菌株。
一个单位是指在50μL总反应体积中,37℃条件下,20min内从20pmol荧光标记的50bp RNA-DNA杂合链中产生1nmol核糖核苷酸所需的酶量。
组分 | 250U | 1000U | 5000U |
RNase H(5U/μL) | 50μL | 200μL | 1mL |
10×Reaction Buffer | 250μL | 1mL | 5mL |
保存:-20℃,有效期2年。
不含DNA内切酶和外切酶,不含其它核糖核酸酶。
10mM Tris-HCl,50mM KCl,1mM DTT,0.1mM EDTA,200μg/mL BSA,50% (v/v) glycerol,pH7.4@25℃。
10×Reaction Buffer:
500mM Tris-HCl,750mM KCl,30mM MgCl2,100mM DTT,pH8.3@25℃。
65℃加热10分钟可使RNase H失活。金属离子螯合剂和巯基封闭剂均能抑制RNase H活性,加入EDTA至终浓度为至少5mM可抑制RNase H的酶活性。
图1.RNase H催化降解RNA:DNA杂合双链中RNA链的效果图。使用本制品或N公司的RNase H,在20μL反应体系中,加入400ng RNA:DNA杂合双链,以及图中指定量的RNase H,37℃孵育20分钟进行反应,反应完毕后立即冰浴3~5分钟并加入1μL 0.5M EDTA以终止反应。取出5μL反应液,加入1μL 6×DNA上样缓冲液(货号:YT418),然后进行15%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(180V电泳45分钟)之后,用NadRed红色核酸染料(1:2000稀释)室温染色7分钟,随后拍照观察结果。如图所示,本制品与N公司的竞品相比,具有类似的催化效果。图中效果仅供参考。
- DNA-RNA杂合链中去除RNA:
- 用反转录酶,例如BalbRT M-MuLV反转录酶或BalbRT M-MuLV反转录酶(RNase H-)合成cDNA第一条链,70℃孵育10分钟终止反应。
- 在冰浴上向已经合成第一条链的20μL反应体系中依次加入如下试剂:
成分 用量 10×Reaction Buffer 2μL 无核酸酶去离子水 17.8μL RNase H(5U/μL) 0.2μL - 按上述体系配好之后,轻轻混匀(可以用移液器吹打混匀或用Vortex在最低速度轻轻混匀),随后离心沉淀液体。
- 37℃孵育1小时。
- 加入2.5μL 0.5M EDTA(pH8.0)混匀,以终止反应。
- 后续可以使用酚氯仿抽提、乙醇沉淀等方法纯化合成的双链cDNA,也可以使用适当的DNA纯化试剂盒进行纯化。PCR产物DNA纯化试剂盒(货号:YT009)可以向百奥莱博订购。
说明:其他情况DNA-RNA杂合链中去除RNA的条件可以参考上述条件进行。RNase H反应的pH范围约在7.5-8.3均可。
- 用反转录酶,例如BalbRT M-MuLV反转录酶或BalbRT M-MuLV反转录酶(RNase H-)合成cDNA第一条链,70℃孵育10分钟终止反应。
- 杂合链中RNA的去除和cDNA第二链的合成:
- 用反转录酶,例如BalbRT M-MuLV反转录酶(货号:YT392)、BalbRT M-MuLV反转录酶(RNase H-)(货号:YT393)或BalbRT cDNA第一链合成试剂盒(货号:YT395)合成cDNA第一条链,70℃孵育10分钟终止反应。
- 在冰浴上向已经合成第一条链的20μL反应体系中依次加入如下试剂:
成分 用量 10×DPMI Reaction Buffer 8μL 无核酸酶去离子水 68.8μL RNase H(5U/μL) 0.2μL DNA Polymerase I,E.coli 3μL(30U)
注:10×DPMI Reaction Buffer:500mM Tris-HCl(pH7.5 at 25℃),100mM MgCl2,10mM DTT。 - 按上述体系配好之后,轻轻混匀(可以用移液器吹打混匀或用Vortex在最低速度轻轻混匀),随后离心沉淀液体。
- 15℃孵育2小时。
注:反应温度不能超过15℃。 - 加入5μL 0.5M EDTA(pH8.0)混匀,以终止反应。
- 后续可以使用酚氯仿抽提、乙醇沉淀等方法纯化合成的双链cDNA,也可以使用适当的DNA纯化试剂盒进行纯化。PCR产物DNA纯化试剂盒(货号:YT009)可以向百奥莱博订购。
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- 用反转录酶,例如BalbRT M-MuLV反转录酶(货号:YT392)、BalbRT M-MuLV反转录酶(RNase H-)(货号:YT393)或BalbRT cDNA第一链合成试剂盒(货号:YT395)合成cDNA第一条链,70℃孵育10分钟终止反应。
- 其他用途请参考上述用途或相关文献资料进行。
- 解冻10×Reaction Buffer反应缓冲液时为什么有时会出现白色沉淀,如何解决?
白色沉淀物是10×Reaction Buffer缓冲液中的DTT,解冻和混合后会再次悬浮。重新悬浮的缓冲液完全可以满足其预期用途。 - RNase H切割RNA碱基的哪一侧?
RNase H裂解RNA的3'-O-P键,生成3'羟基和5'磷酸盐产物。 - 30℃时RNase H的活性怎么样?
在30℃下,RNase H的活性约为90%。
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